La radioprotezione si occupa della protezione dei lavoratori e della popolazione dagli effetti dannosi delle radiazioni ionizzanti (d.lgs 230/95 e successive modifiche).

La Struttura si occupa di tutti gli adempimenti tecnici e giuridici connessi alle attività che comportano l'impiego delle sorgenti sia in fase progettuale che in fase di esercizio, dell'informazione dei lavoratori sui rischi specifici legati all'esposizione a radiazioni ionizzanti ed è coinvolta nella gestione delle emergenze radiologiche intraospedaliere.

Gestisce il Laboratorio di Dosimetria e Spettrometria e l'intera strumenta'zione utilizzata ai fini della sorveglianza sui rischi derivanti dall'esposizione lavorativa alle radiazioni ionizzanti.
In particolare il Laboratorio di Dosimetria lavora circa 15.000 dosimetri a film/anno e circa 1.000 dosimetri a TLD/anno, sia per Niguarda che per conto di terzi (industrie ed altre A.O.) sulla base di metodiche analitiche oggetto di pubblicazione su riviste internazionali.
Il Laboratorio di Spettrometria effettua invece la determinazione delle concentrazioni di sostanze radioattive in tracce contenute in campioni biologici o prelevati negli ambienti di lavoro al fine di certificarne l'eventuale radiocontaminazione.
Vengono effettuate circa 700 analisi all'anno sia per i dipendenti di Niguarda che per conto di terzi (Industrie ed altre A.O.) utilizzando due spettrometri HPGe, un rivelatore NaI(Tl) e un rivelatore a scintillazione liquida.

La Struttura effettua inoltre il monitoraggio tiroideo a scopo radioprotezionistico dei soggetti a rischio di incorporazione di 131-I.