Microbiologia Clinica

Dipartimento dei Servizi
DIRETTORE: VISMARA Chiara Silvia
COORDINATORE TECNICO: Baldo Alberto

STAFF: BIELLI Alessandra,  BRACCHITTA Fiorenza,  BUSNI Andrea,  CASALICCHIO Giorgia,  DE GIORGI Stefano,  FALCONE Leonarda,  FANTI Diana,  FERRARA Antonina Tindara,  MATARAZZO Elisa,  NAVA Alice,  PISANÒ Giorgia Maria,  RACO Domenico,  ROMEO Lorenzo,  TARTAGLIONE Livia,  TORRI Stefania

TEL SEGRETERIA: 02 6444.3162 (lun-ven 8.00-11.00)
MAIL SEGRETERIA: esamilaboratorio@ospedaleniguarda.it

La Microbiologia Clinica effettua indagini di diagnostica e monitoraggio delle principali patologie infettive.
Il laboratorio è parte attiva nello sviluppo di protocolli diagnostico-terapeutici per l’implementazione dell’appropriatezza delle richieste. Parte dell’attività è dedicata alla ricerca e sviluppo di aspetti metodologici per un continuo aggiornamento nel supporto alla clinica. Di particolare rilevanza è l’area dedicata al paziente critico, con l’uso di metodiche molecolari per la diagnosi rapida di sepsi e di infezioni respiratorie nei pazienti critici

La struttura processa campioni di provenienza interna (reparti di degenza e ambulatori) ed esterna (centro prelievi, enti pubblici e privati convenzionati). Il laboratorio è operativo in orario diurno 7 giorni su 7 e dispone di un servizio di guardia attiva dalle 8.00 alle 20.00 e di pronta disponibilità dalle 20.00 alle 8.00 per esami a carattere di urgenza e non differibili. Esegue circa 900.000 prestazioni l’anno.


Principali aree di attività

•    Batteriologia: attività diagnostica dedicata alle infezioni batteriche e fungine e sorveglianza attiva per i patogeni multiresistenti. I metodi fenotipici e molecolari utilizzati sono di ultima generazione sia per identificazione (spettrometria di massa) che per la sensibilità agli antibiotici e agli antimicotici (brododiluizione e ricerca di geni associati a farmacoresistenze). L’attività di sorveglianza continua dell’antibiotico-resistenza è garantita anche dalla produzione di report periodici che riportano le resistenze dei patogeni isolati da sangue e dagli altri materiali. Il settore ha un’area dedicata alla parassitologia ematica e fecale. Il laboratorio è all’avanguardia nel campo dell’automazione con una completa tracciabilità del campione dalla semina all’interpretazione dei risultati. È Centro di Riferimento Regionale per la Legionellosi con mandato di gestire la ceppoteca regionale e la sorveglianza epidemiologica per lo studio e l’individuazione dei focolai. È parte attiva del CIO (Comitato Infezioni Ospedaliere) e svolge attività in stretta collaborazione con la Direzione per la sorveglianza delle infezioni. Il laboratorio partecipa ai sistemi regionali, e nazionali (AR-ISS) di sorveglianza delle resistenze e a programmi di controlli di qualità esterni nazionali ed europei (VEQ e Neqas ed EARS-Net).

•    Micobatteri: laboratorio di terzo livello, Centro di Riferimento Regionale, e sede della ceppoteca regionale di Mycobacterium tuberculosis.complex.Il laboratorio esegue antibiogrammi di primo e secondo livello per micobatteri tubercolari, anche per ceppi multiresistenti. Svolge attività di sorveglianza epidemiologica per l’individuazione di focolai epidemici di tubercolosi mediante sequenziamento dei ceppi. Garantisce l’identificazione di tutti i micobatteri non tubercolari con esecuzione di antibiogramma nei casi indicati. Il laboratorio è dotato di una stanza di biosicurezza di livello 3 per poter lavorare con microrganismi ad elevata patogenicità.

•    Diagnostica Molecolare: settore dedicato alla diagnostica molecolare specifica, per l'identificazione di infezioni virali, batteriche e micotiche. Esegue test di genotipizzazione per l’identificazione di ceppi virali e batterici, e per l’individuazione di geni di resistenza, con metodiche di sequenziamento anche in NGS; monitora la terapia per HIV e HBV mediante l’individuazione di farmacoresistenza con metodica di sequenziamento.  Ricerca agenti responsabili di malattie sessualmente trasmesse (Chlamidia trachomatis, manca Neisseria gonorrhoeae, Mycoplasma genitalium e hominis, Ureaplasma urealytyicum e parvum, Trichomonas vaginalis, HPV screening e relativa genotipizzazione). Ricerca agenti virali responsabili di infezioni del sistema nervoso centrale, pannello virus erpetici, enterovirus e virus JC. Ricerca agenti virali responsabili di infezioni respiratorie. Esegue test dedicati all’identificazione di infezioni virali per patologie emergenti a riscontro non frequente (Zika, Chikungunya e Dengue). Il settore ha un’area dedicata al monitoraggio dei pazienti trapiantati che, oltre a quantificare la carica virale di Cytomegalovirus (CMV), virus di Epstein-Barr (EBV), polyomavirus BK (BKV), herpes virus umano 6 (HHV6), è costantemente orientata alla valutazione e introduzione di nuove metodiche per la ricerca di virus emergenti. Il laboratorio appartiene alla rete regionale lombarda e alla rete nazionale del Ministero e dell’Istituto Superiore di Sanità per la diagnosi ed il sequenziamento di SARS-CoV-2.

•    Immunodiagnostica Infettivologica: il settore effettua test per la diagnosi sierologica delle patologie infettive, eseguendo un ampio pannello di esami anche per patologie a riscontro non frequente e per pazienti immunocompromessi. Esegue test per la diagnosi sierologica di epatiti virali tipo A, B, C, Delta ed E, compresi test quantitativi per HBsAg e HBeAg. Effettua analisi per le principali infezioni trasmissibili in gravidanza ToRCH e Parvovirus fornendo supporto ai ginecologi di ambulatori e consultori per i casi di sospette sieroconversioni. Sono attive metodiche in immunofluorescenza per il dosaggio del titolo anticorpale per febbre Q, Schistosomiasi, Leishmaniosi e per malattie virali da Coxsackie, Herpes 6, Herpes 8 (fase latente e litica). Effettua anche test di secondo livello (e.g. Immunoblot per malattia di Lyme su siero e liquor) e saggi di valutazione della risposta cellulo-mediata per alcune patologie di particolare interesse clinico, tra le quali la diagnosi di tubercolosi latente e l’infezione da SARS-CoV-2. Il laboratorio è Centro di riferimento NITp (Nord Italian Transplant) per l’esecuzione di test di secondo livello per la valutazione dell'idoneità del donatore di organo e tessuti.

Aree ad alta specializzazione

Tubercolosi: Centro di Riferimento Regione Lombardia per Mycobacterium tuberculosis complex 

Legionellosi: Centro di Riferimento Regione Lombardia per gli isolati clinici.

Attività di monitoraggio e supporto per la validazione di donatori di sangue, organo e tessuti per il NITp (Nord Italian Transplant: program: Lombardia, Liguria, Veneto, Trentino Alto Adige, Friuli Venezia Giulia, Marche): centro di riferimento per l’esecuzione di test di primo livello (SARS-CoV-2 in biologia molecolare) e di conferma di secondo livello sui donatori di sangue e di organo.

Il laboratorio è parte attiva nella stesura di Linee Guida Regionali per lo screening e la diagnosi di diagnosi della Tubercolosi, collabora con Regione per i progetti di sorveglianza delle Infezioni nosocomiali
 

Formazione e didattica



La SC Microbiologia Clinica
•    gestisce il corso di “Microbiologia e microbiologia clinica” nell’insegnamento “Patogenesi e diagnostica” del corso di laurea in Infermieristica dell’Università degli Studi di Milano
•    segue personale in formazione, specializzandi in Microbiologia e Virologia e studenti in tesi. 
 

L’elenco completo delle prestazioni eseguite con i relativi tempi di refertazione e modalità di raccolta dei campioni sono consultabili via internet: esami di laboratorio>>